Efecte pozitive ale izoflavonelor se transmit în protecţia împotriva bolilor cardiovasculare şi duc la scăderea incidenţei câtorva tipuri de cancer, în special cancerul de sân. Deşi mecanismul de protecţie împotriva apariţiei cancerului implică mai multe aspecte ale metabolizării izoflavonelor, cei mai mulţi oameni de ştiinţă atribuie acest efect asemănării între structura izoflavonelor din soia şi cea a estrogenilor. Acesta similitudine permite izoflavonelor să dizlocuiasca estrogenii de pe receptorii celulari, astfel blocându-le activitatea hormonală - mecanismul este similar cu cel al unor medicamente care sunt utilizate de mulţi culturişti pentru a bloca conversia steroizilor anabolizanţi în estrogeni, proces care poate duce la "feminizare", în principal manifestată prin ginecomastie).